Basi molecolari della poliendocrinopatia autoimmune di tipoI: studi funzionali e strutturali sul dominio PHD finger della proteina AIRE
- 5 Anni 2008/2013
- 800.000€ Totale Fondi
La poliendocrinopatia autoimmune di tipo I (APECED) è una rara malattia autosomica recessiva caratterizzata da fenomeni autoimmuni diretti principalmente contro il sistema endocrino. La sindrome si manifesta con candidiasi muco-cutanee, ipoparatiroidismo autoimmune, malattia di Addison e insufficienza gonadica. Nonostante i progressi nelle terapie i pazienti hanno una bassa qualità di vita ed un'aspettativa di vita estremamente ridotta. La malattia è causata da mutazioni (puntiformi o delezioni) nel gene regolatore autoimmune AIRE che codifica per la proteina AIRE (~600 aminoacidi) la cui funzione è tuttora poco chiara. Abbiamo recentemente dimostrato che AIRE funziona come attivatore di trascrizione associandosi direttamente alla proteina istone H3, tramite un meccanismo che sinora non era stato mai descritto e che coinvolge una porzione di AIRE denominata PHD finger. I dettagli molecolari di tale meccanismo son tuttora sconosciuti
Obiettivo del progetto è la caratterizzazione a livello atomico tramite risonanza magnetica nucleare dell'interazione tra AIRE-PHD1 e una porzione dell'istone H3. E' noto inoltre che mutazioni all'interno di AIRE-PHD1 causano APECED, il nostro obiettivo è¨ quindi di caratterizzare l'effetto di tali mutazioni nell'interazione con H3.
La funzione di una proteina è strettamente legata ai suoi interattori. Al momento sono noti solo pochissimi interattori di AIRE, obiettivo di questo progetto è di identificare ligandi di AIRE tramiti metodi proteomici e di caratterizzare a livello atomico tali interazioni.
Obiettivo ultimo del progetto è di chiarire ulteriormente sia la funzione di AIRE che il suo ruolo nella patogenesi di APECED.
Pubblicazioni Scientifiche
- 2014 AMERICAN JOURNAL OF MEDICAL GENETICS PART A
Identification of a Novel de Novo Deletion in RAF1 Associated With Biventricular Hypertrophy in Noonan Syndrome
- 2015 ACS CHEM BIOL
Structure-Based Design of a B Cell Antigen from B. pseudomallei
- 2012 PLOS ONE
Exploring PHD Fingers and H3K4me0 Interactions with Molecular Dynamics Simulations and Binding Free Energy Calculations: AIRE-PHD1, a Comparative Study
- 2011 JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH
Metabolomics of B to Plasma Cell Differentiation
- 2008 EPIGENETICS
PHD finger of autoimmune regulator An epigenetic link between the histone modifications and tissue-specific antigen expression in thymus
- 2010 ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION
2D TR-NOESY Experiments Interrogate and Rank Ligand-Receptor Interactions in Living Human Cancer Cells
- 2013 BIOCHIMIE
The stem cell secretome and its role in brain repair
- 2012 Nucleic acids research
AIRE-PHD fingers are structural hubs to maintain the integrity of chromatin-associated interactome
- 2011 CHEMISTRY-AN ASIAN JOURNAL
HMGB1-Carbenoxolone Interactions: Dynamics Insights from Combined Nuclear Magnetic Resonance and Molecular Dynamics
- 2014 BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-MOLECULAR BASIS OF DISEASE
The biophysical and biochemical properties of the autoimmune regulator (AIRE) protein
- 2013 STROKE
Safety and Efficacy of Transcranial Direct Current Stimulation in Acute Experimental Ischemic Stroke
- 2011 ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION
Use of Metadynamics in the Design of isoDGR-Based alpha v beta 3 Antagonists To Fine-Tune the Conformational Ensemble
- 2012 ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION
Molecular Dynamics Reveal that isoDGR-Containing Cyclopeptides Are True alpha v beta 3 Antagonists Unable To Promote Integrin Allostery and Activation
- 2009 Nucleic acids research
The solution structure of the first PHD finger of autoimmune regulator in complex with non-modified histone H3 tail reveals the antagonistic role of H3R2 methylation
- 2015 JOURNAL OF IMMUNOLOGY RESEARCH
SP140L, an Evolutionarily Recent Member of the SP100 Family, Is an Autoantigen in Primary Biliary Cirrhosis
- 2014 BIOMOL NMR ASSIGN
H-1, C-13, N-15 backbone and side chain NMR resonance assignments of BPSL1050 from Burkholderia pseudomallei
- 2015 JOURNAL OF CELLULAR AND MOLECULAR MEDICINE
Identification of TMPRSS6 cleavage sites of hemojuvelin
- 2008 JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
Structural basis for the interaction of isoDGR with the RGD-binding site of alpha v beta 3 integrin
- 2010 PLOS ONE
Nephrocystin-1 Forms a Complex with Polycystin-1 via a Polyproline Motif/SH3 Domain Interaction and Regulates the Apoptotic Response in Mammals
- 2011 BIOINFORMATICS
The CCPN Metabolomics Project: a fast protocol for metabolite identification by 2D-NMR
- 2014 JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
Oxidation-induced Structural Changes of Ceruloplasmin Foster NGR Motif Deamidation That Promotes Integrin Binding and Signaling
- 2008 Blood
Structural and functional effects of hereditary hemolytic anemia-associated point mutations in the alpha spectrin tetramer site
- 2014 ADVANCES IN EXPERIMENTAL MEDICINE AND BIOLOGY
NMR and Computational Methods in the Structural and Dynamic Characterization of Ligand-Receptor Interactions
- 2014 FEBS Journal
Structure of human Sp140 PHD finger: an atypical fold interacting with Pin1